Tässä työjärjestyksessä säädetään sen ohessa, mitä erikseen säädetään, ministeriön hallinnonalan ohjauksesta, ministeriön johtamisesta ja johtoryhmistä, ministeriön sisäisestä organisaatiosta, johtavien virkamiesten asemasta ja tehtävistä sekä asioiden valmistelusta ja virkamiesten ratkaisuvallasta.

Ministeriö antaa taloussäännön sekä sisäisen tarkastuksen ohjesäännön siten kuin niistä erikseen säädetään. Ministeriön sisäisestä tarkastuksesta määrätään sisäisen tarkastuksen ohjesäännössä.

Liikenne- ja viestintäministeriöstä annetun valtioneuvoston asetuksen (405/2003) 3 §:ssä tarkoitettuja ministeriön osastoja ja muita toimintayksiköitä ovat yleinen osasto, liikennepolitiikan osasto, viestintäpolitiikan osasto ja ministeriön viestintä. Mitä jäljempänä säädetään osastosta, koskee soveltuvin osin myös ministeriön viestintää.

Sisäinen tarkastus toimii suoraan kansliapäällikön alaisuudessa.

Kansliapäällikön tehtävistä säädetään valtioneuvoston ohjesäännössä (262/2003).

Osaston päällikkönä on osastopäällikkö. Osastopäällikön apuna voi olla apulaisosastopäällikkö. Hallinto- ja kehityspalvelujen päällikkönä on hallintojohtaja ja ministeriön viestinnän päällikkönä viestintäjohtaja. Yksiköiden ja ryhmien päälliköt määrää ministeri.