Ylijohtaja johtaa viraston toimintaa ja vastaa sille asetettujen tulostavoitteiden saavuttamisesta ja siitä, että viraston tehtävät hoidetaan taloudellisesti ja tehokkaasti. Ylijohtajan tulee seurata viraston toimialan kehitystä sekä huolehtia viraston toiminnan yleisestä kehittämisestä ja uudistamisesta.

Ylijohtajan lisäksi virastossa on johtajia, hallintojohtaja, tietojohtaja sekä muuta virka- ja työsopimussuhteessa olevaa henkilöstöä. Johtajat johtavat vastuualueensa toimintaa ja vastaavat sille sosiaali- ja terveysministeriön ja viraston välisessä tulossopimuksessa sekä viraston toimintasuunnitelmassa asetettujen tavoitteiden toteutumisesta.

Ylijohtajan nimittää valtioneuvosto.

Muun virka- tai työsopimussuhteisen henkilöstön nimittää tai ottaa palvelukseen ylijohtaja tai muu viraston henkilöstöön kuuluva siten kuin työjärjestyksessä määrätään.