Vesioikeudella on sijaintipaikallaan kanslia.

Hallintoasioita käsittelevät vesioikeuden yhteisistunto, hallintojaosto ja vesioikeuden päällikkö.

Yhteisistuntoon osallistuvat vesioikeustuomarit, vesioikeusinsinöörit ja vesioikeuslimnologit. Yhteisistunnon puheenjohtajana toimii vesioikeuden päällikkö.

Yhteisistunto on päätösvaltainen, kun puheenjohtajan lisäksi vähintään puolet sen jäsenistä on saapuvilla.

Hallintojaostoon kuuluvat vesioikeuden päällikkö puheenjohtajana sekä jäseninä muut vesioikeustuomarit ja kaksi yhteisistunnon kalenterivuodeksi kerrallaan vesioikeusinsinööreistä ja vesioikeuslimnologeista valitsemaa jäsentä. Yhteisistunto valitsee hallintojaostoon kalenterivuodeksi kerrallaan vesioikeusinsinööreistä ja vesioikeuslimnologeista myös kaksi varajäsentä.

Hallintojaosto on päätösvaltainen, kun puheenjohtaja ja vähintään kaksi jäsentä on saapuvilla.

Vesilain 15 luvun 4 §:n 2 momentissa tarkoitettu ylimääräinen vesioikeustuomari ei kuulu hallintojaostoon eikä sen jäseneksi tai varajäseneksi voida valita sanotussa lainkohdassa tarkoitettua muuta vesioikeuden ylimääräistä jäsentä.

Yhteisistunnossa asiat ratkaistaan vesioikeuden sihteerin esittelystä. Hallintojaostossa asiat ratkaistaan vesioikeuden sihteerin tai osastosihteeri...